Criado de acordo com a resolução nº1 do II ENARQUIFES, o Comitê Nacional tem como objetivo garantir, divulgar e acompanhar a execução das resoluções do encontro, é composto por dois representantes de cada região eleitos durante o ENARQUIFES.
Aprovada no IV ENARQUIFES, a atual composição dos membros da CNIFES são:
Região Nordeste:
Renato Motta Rodrigues da Silva – UFRPE
Euliene Rocha – UFCG
Região Sudeste:
Priscila Carvalho – UNIRIO
Igor José Garcez– UFF
Região Sul:
Cristiano Cavalheiro Lutz – UFSC
Andrea Gonçalves – FURG
Região Centro-Oeste:
Gleice Nogueira – UFMS
Cínthia Frasão – IFG
A Região Norte ainda não definiu seus representantes.